تشمل مؤشرات صحة النظام البيئي عدة عوامل، منها:
التنوع البيولوجي: يشير إلى تنوع الكائنات الحية داخل النظام البيئي، فكلما زاد التنوع، زادت قدرة النظام على التكيف والصمود.
عدم تفشي الأمراض: يدل غياب الأمراض أو قلتها على توازن النظام البيئي واستقراره.
قدرة النظام على استعادة التوازن: تعكس قدرة النظام على التعافي من الاضطرابات والتغيرات قوة بنيته وقدرته على الاستمرار.