قد تؤدي الفيرومونات إلى استجابات غير متوقعة أو غير مرغوب فيها، خاصةً عند استخدامها بشكل غير صحيح أو بتركيزات عالية.
قد تتفاعل الفيرومونات مع الأدوية أو الحالات الطبية الأخرى، مما يؤدي إلى آثار جانبية غير متوقعة.
قد يكون من الصعب التحكم في تأثير الفيرومونات، حيث يمكن أن تختلف الاستجابة من شخص لآخر.
هناك بعض المخاوف الأخلاقية المحتملة بشأن استخدام الفيرومونات للتأثير على سلوك الآخرين.