من أهم العوامل المهددة للتنوع الحيوي:
فقدان وتدهور الموائل: تدمير الغابات، تجفيف الأراضي الرطبة، تحويل الأراضي الزراعية إلى مناطق حضرية، وتفتيت الموائل الطبيعية.
الاستغلال المفرط للموارد الطبيعية: الصيد الجائر، قطع الأشجار غير المستدام، والصيد المفرط للأسماك.
التلوث: تلوث الهواء، الماء، والتربة بالمواد الكيميائية والنفايات.
إدخال الأنواع الغريبة الغازية: إدخال أنواع نباتية أو حيوانية جديدة إلى بيئة غير موطنها الأصلي، مما قد يؤدي إلى منافسة الأنواع المحلية أو افتراسها.
تغير المناخ: ارتفاع درجات الحرارة، تغير أنماط هطول الأمطار، وارتفاع مستوى سطح البحر، مما يؤثر على توزيع الكائنات الحية وقدرتها على البقاء.