لو: حرف شرط غير جازم.
أن: حرف ناسخ مشبه بالفعل.
الياء: ضمير متصل مبني على السكون في محل نصب اسم "أن".
حبة: خبر "أن" مرفوع وعلامة رفعه الضمة الظاهرة على آخره.
قمح: مضاف إليه مجرور وعلامة جره الكسرة الظاهرة على آخره.
مروية: نعت لـ "حبة" مرفوع وعلامة رفعه الضمة الظاهرة على آخره.
بمياه: جار ومجرور، الباء حرف جر، مياه اسم مجرور وعلامة جره الكسرة الظاهرة على آخره.
النهر: مضاف إليه مجرور وعلامة جره الكسرة الظاهرة على آخره.
وجملة "أني حبة قمح مروية بمياه النهر" في محل رفع خبر للمبتدأ المحذوف تقديره "أنا" (لو أني... لو كنت أنا...). وجملة "لو أني حبة قمح مروية بمياه النهر" ابتدائية لا محل لها من الإعراب.