الفرق الأساسي بين النباتات البذرية اللازهرية (مثل الصنوبريات والسيكاسيات) والنباتات البذرية الزهرية (النباتات المزهرة) يكمن في طريقة التكاثر وتركيب الأعضاء التناسلية.
طريقة التكاثر
النباتات البذرية اللازهرية لا تنتج أزهارًا. بدلًا من ذلك، تتكون بذورها عادةً في هياكل مخروطية (مثل المخاريط الصنوبرية)، وتكون البذور "عارية" أو غير مغلفة داخل مبيض.
النباتات البذرية الزهرية تنتج أزهارًا، وهي الأعضاء التناسلية للنبات. تتطور البذور داخل مبيض الزهرة، والذي بدوره يتطور إلى ثمرة بعد الإخصاب لحماية البذور.
الأعضاء التناسلية
في النباتات البذرية اللازهرية، الأعضاء التناسلية الذكرية والأنثوية غالبًا ما تكون منفصلة وتوجد على شكل مخاريط ذكرية وأنثوية.
في النباتات البذرية الزهرية، توجد الأعضاء التناسلية (الأسدية والمدقة) داخل الزهرة، وقد تكون الزهرة تحتوي على كلا النوعين من الأعضاء (زهرة خنثى) أو نوع واحد فقط (زهرة وحيدة الجنس).