تحدث عملية التخمر في السيتوبلازم، وهو الجزء الداخلي للخلية.
يعتمد موقع التخمر على نوع التخمر:
التخمر الكحولي: يحدث في السيتوبلازم لخلايا الخميرة.
التخمر اللبني: يحدث في السيتوبلازم لخلايا الحيوانات والنباتات.
التخمر الهومولاكتيكي: يحدث في السيتوبلازم لبعض البكتيريا.
التخمر الهيتيرولاكتيكي: يحدث في كل من السيتوبلازم وغشاء الخلية لبعض البكتيريا.
بشكل عام، تفضل عمليات التخمر بيئة لاهوائية، أي بدون وجود الأكسجين.
ملاحظة: قد تختلف مواقع الإنزيمات المسؤولة عن خطوات التخمر داخل السيتوبلازم.
أمثلة:
في الخميرة، توجد الإنزيمات المسؤولة عن التخمر الكحولي في سائل السيتوبلازم.
في عضلات الإنسان، توجد الإنزيمات المسؤولة عن التخمر اللبني في مصفوفة الميتوكوندريا.