في جملة "فكان يجمع النباتات":
الفاء: حرف عطف مبني على الفتح لا محل له من الإعراب.
كان: فعل ماض ناقص ناسخ مبني على الفتح لا محل له من الإعراب، واسمه ضمير مستتر جوازًا تقديره "هو".
يجمع: فعل مضارع مرفوع وعلامة رفعه الضمة الظاهرة على آخره، وفاعله ضمير مستتر جوازًا تقديره "هو". والجملة الفعلية "يجمع النباتات" في محل نصب خبر "كان".
النباتات: مفعول به منصوب وعلامة نصبه الكسرة النائبة عن الفتحة لأنه جمع مؤنث سالم.