نموذج افتراضي لبروتين مكون من أحماض أمينية:
1. الخصائص العامة:
الطول: 100 حمض أميني
الوزن الجزيئي: 11,000 دالتون
النقطة الأيزوإلكتريكية: 5.5
الاستقرار: مستقر في درجات حرارة معتدلة (20-40 درجة مئوية)
الذوبان: قابل للذوبان في الماء
2. التركيب:
الحمض الأميني N-terminal: ميثيونين
الحمض الأميني C-terminal: ليسين
التكوين:
20% أحماض أمينية محبة للماء (حمض الجلوتاميك، حمض الأسبارتيك، ليسين، أرجينين، ...)
20% أحماض أمينية كارهة للماء (ميثيونين، ألانين، فالين، ليسين، ...)
20% أحماض أمينية محايدة (سيستين، سيرين، ثريونين، تيروزين، ...)
40% أحماض أمينية خاصة (هستيدين، برولين، جليسين، ...)
3. الوظيفة:
الارتباط بالجزيئات الأخرى:
جيب هيدروفوبي لربط الجزيئات الكارهة للماء
موقع شحنة موجبة لربط الجزيئات سالبة الشحنة
موقع شحنة سالبة لربط الجزيئات موجبة الشحنة
التحفيز:
موقع نشط يحتوي على حمض أميني حامض وقاعدة
موقع ربط للركيزة
الإشارات:
تسلسل محدد من الأحماض الأمينية يتعرف عليه بروتين آخر
4. التنظيم:
التعديلات بعد الترجمة:
فوسفات
يوبيكويتين
جليكوزيل
التفاعلات البروتين-بروتين:
تفاعلات محددة مع بروتينات أخرى
تفاعلات غير محددة مع بروتينات أخرى
5. الموقع الخلوي:
السيتوبلازم:
موقع نشط في السيتوبلازم
قابلية للانتقال إلى النواة
النواة:
تسلسل إشارات نووية
موقع ربط الحمض النووي
6. الأمراض:
طفرة في جين البروتين:
فقدان الوظيفة
اكتساب وظيفة جديدة
التعبير الزائد عن البروتين:
أمراض وراثية
السرطان
ملاحظة: هذا مجرد نموذج افتراضي، ويمكن أن تختلف خصائص البروتين الفعلية بشكل كبير اعتمادًا على وظيفته وموقعه الخلوي.
ملاحظة: هذا النموذج لا يمثل أي بروتين موجود في الطبيعة، بل هو مجرد مثال لتصميم بروتين افتراضي.